دیدگاه‌های شیخ احمد احسائی در میان علما با واکنش‌های متفاوتی روبرو شد. گروهی از علما با این دیدگاه‌ها کنار آمده و آن‌ها را پذیرفتند؛ هرچند چهره‌های شاخصی که به طور صریح از او حمایت کرده باشند، در این میان کمتر به چشم می‌خورند. در مقابل، گروهی دیگر، از جمله مرحوم کلباسی و صاحب روضات، با وجود اینکه نگاه مثبتی به شخصیت شیخ احمد احسائی داشتند، اما با برخی از عقاید او متفاوت بودند.
اما مخالفت‌های بسیار جدی‌تر از سوی برجسته‌ترین علمای آن زمان، به خصوص اصولیون، ابراز شد. علمایی از نجف، کربلا، اصفهان، قزوین و دیگر مراکز علمی از مخالفان سرسخت شیخ احمد احسائی بودند. از چهره‌های شاخص این مخالفان می‌توان به مرحوم محمدتقی برغانی و برادرش محمدصالح برغانی اشاره کرد. این دو که در قزوین اقامت داشتند، مواجهه مستقیم و رو در رویی با شیخ احسائی داشتند و در نهایت حکم به تکفیر او دادند. علاوه بر این، بزرگانی چون صاحب جواهر و صاحب فصول نیز از مخالفین عقیدتی شیخ احمد احسائی به شمار می‌روند.
